- 丹砂
- 云母
- 玉屑
- 玉泉
- 石钟乳
- 矾石
- 硝石
- 芒硝
- 朴硝
- 玄明粉
- 马牙硝
- 生硝
- 滑石
- 石胆
- 空青
- 曾青
- 禹余粮
- 太一余粮
- 白石英
- 紫石英
- 青石脂
- 赤石脂
- 黄石脂
- 白石脂
- 黑石脂
- 白青
- 绿青
- 石中黄子
- 无名异
- 菩萨石
- 婆娑石
- 绿矾
- 柳絮矾
- 扁青
- 卷三（短集之）
- 雄黄
- 石硫黄
- 雌黄
- 食盐
- 水银
- 石膏
- 金屑
- 银屑
- 生银
- 灵砂
- 水银粉
- 磁石
- 玄石
- 绿盐
- 凝水石
- 阳起石
- 孔公孽
- 殷孽
- 密陀僧
- 铁精
- 铁浆
- 秤锤
- 铁华粉
- 生铁
- 铁粉
- 铁落
- 钢铁
- 铁
- 石脑
- 理石
- 珊瑚
- 石蟹
- 长石
- 马衔
- 砺石
- 石花
- 桃花石
- 光明盐
- 石床
- 肤青
- 玛瑙
- 太阴玄精
- 卷四（短集之）
- 诸土有毒
- 伏龙肝
- 锻石
- 石
- 砒霜
- 铛墨
- 砂
- 铅丹
- 铅
- 粉锡
- 东壁土
- 赤铜屑
- 锡铜镜鼻
- 铜青
- 井底沙
- 代赭
- 石燕
- 戎盐
- 大盐
- 卤咸
- 浆水
- 井华水
- 菊花水
- 地浆
- 腊雪
- 泉水
- 半天河
- 热汤
- 白垩
- 冬灰
- 青琅
- 自然铜
- 金牙
- 铜矿石
- 铜弩牙
- 金星石
- 特生石
- 握雪石
- 梁上尘
- 土阴孽
- 车脂
- ?（音工）中膏
- 灶灰
- 淋石
- 方解石
- 礞石
- 姜石
- 井泉石
- 苍石
- 花乳石
- 石蚕
- 石脑油
- 白瓷瓦屑
- 乌古瓦
- 不灰木
- 蓬砂
- 铅霜
- 古文钱
- 蛇黄
- 玉井水
- 卷五（短集之）
- 诸水有毒
- 卷第六
- 黄精
- 菖蒲
- 菊花
- 人参
- 天门冬
- 甘草（国老）
- 干地黄
- 术
- 菟丝子
- 牛膝（为君）
- 茺蔚子
- 女萎
- 防葵
- 茈（柴字）胡（为君）
- 麦门冬（为君）
- 独活
- 升麻
- 车前子
- 木香
- 薯蓣
- 薏（音薏）苡（音以）仁
- 泽泻
- 远志（为君）
- 龙胆
- 细辛
- 石斛
- 巴戟天
- 白英
- 白蒿
- 赤箭
- 庵（音淹）?（音闾）子
- 菥（音锡觅）子
- 蓍实
- 紫芝
- 卷（君免切）柏
- 卷六（短集之）
- 蓝实
- 芎
- 蘼芜
- 黄连
- 络石
- 蒺藜子
- 黄
- 肉苁蓉
- 防风
- 蒲黄
- 香蒲
- 续断
- 漏芦
- 营实
- 天名精
- 决明子
- 丹参
- 茜根
- 飞廉
- 五味子
- 旋花
- 兰草
- 忍冬
- 蛇床子
- 地肤子
- 千岁
- 景天
- 茵陈蒿
- 杜若
- 沙参
- 白兔藿
- 徐长卿
- 石龙刍
- 薇衔
- 云实
- 王不留行
- 卷七（短集之）
- 干姜
- 生姜
- ?（私以切）耳实
- 葛根
- 葛粉
- 栝蒌
- 苦参
- 当归
- 麻黄
- 通草
- 芍药
- 蠡（音礼）实
- 瞿（音劬）麦
- 玄参
- 秦艽（胶字）
- 百合
- 知母
- 贝母
- 白芷
- 淫羊藿
- 黄芩
- 狗脊
- 石龙芮
- 茅根
- 紫菀
- 紫草
- 前胡
- 败酱
- 白藓
- 酸浆
- 紫参
- 本
- 石苇
- 萆
- 杜衡
- 白薇
- 菝（蒲八切）?（弃八切）
- 大青
- 女萎
- 石香
- 卷八（短集之）
- 艾叶
- 恶实
- 水萍
- 王瓜
- 地榆
- 大小蓟根
- 海藻
- 泽兰
- 昆布
- 防己
- 天麻
- 阿魏
- 高良姜
- 百部根
- ？（音怀）香子
- 款冬花
- 红蓝花
- 牡丹
- 京三棱
- 姜黄
- 荜茇
- ？（音矩）酱
- 萝摩子
- 青黛
- 郁金
- 芦荟
- 马先蒿
- 延胡索
- 肉豆蔻
- 补骨脂
- 零陵香
- 缩沙蜜
- 蓬莪术
- 积雪草
- 白前
- 荠
- 白药
- 荭（音红）草
- 莎草根
- 荜澄茄
- 胡黄连
- 红豆蔻
- 艾香
- 甘松香
- 垣衣
- 陟厘（音离）
- 凫葵
- 女菀
- 土马鬃
- 蜀羊泉
- 菟葵
- 鳢肠
- 茅香花
- 使君子
- 王孙
- 莳萝
- 白豆蔻
- 翦草
- 卷九（短集之）
- 附子
- 乌头
- 天雄
- 侧子
- 半夏
- 虎掌
- 由跋
- 鸢尾
- 大黄（将军）
- 葶苈
- 桔梗
- 莨（音浪）菪（音荡）子
- 草蒿
- 旋复花
- 藜芦
- 钩吻
- 射（音夜）干
- 蛇全（合是含字）
- 常山
- 蜀漆
- 甘遂
- 白蔹
- 青葙子
- ？（音桓）菌（音郡）
- 白芨
- 大戟
- 泽漆
- 茵芋
- 赭（音者）魁
- 贯众
- 荛（音饶）花
- 牙子
- 及己
- 羊踯躅
- 卷十（短集之）
- 何首乌
- 商陆
- 威灵仙
- 牵牛子
- 蓖（音卑）麻子
- 蒴
- 天南星
- 羊蹄
- 菰根
- ？（音褊）蓄
- 野狼毒
- ？（音喜）（音）
- 马鞭草
- 苎根
- 白头翁
- 甘蕉根
- 芦根
- 鬼臼
- 角蒿
- 马兜铃
- 仙茅
- 羊桃
- 鼠尾草
- 女青
- 胡麻鞋底
- 刘寄奴草
- 骨碎补
- 连翘
- 续随子
- 败蒲席
- 山豆根
- 三白草
- ？（音闾）茹（音如）
- 蛇莓（音每）汁
- 金星草
- 草
- 鹤虱
- 地菘
- 燕麦
- 甑带灰
- 赤地利
- 乌韭
- 白附子
- 紫葛
- 独行根
- 猪膏莓（音每）
- 鹿藿
- 蚤（音早）休
- 石长生
- 乌蔹（音敛）莓
- 陆英
- 预知子
- 葫芦巴
- 弓弩弦
- 木贼
- 荩（音烬）草
- 蒲公草
- 谷精草
- 牛扁（音褊）
- 苦（音袄）
- 酢浆草
- 昨叶何草
- ？（音弱）头
- 夏枯草
- 卷十一（短集之一）
- 卷十一（短集之二）
- 诸草有毒
- 桂
- 牡桂
- 菌桂
- 松脂
- 槐实
- 槐胶
- 槐花
- 枸杞
- 柏实
- 茯苓
- 琥珀
- 榆皮
- 酸枣
- 柏木（黄柏也）
- 楮实
- 干漆
- 五加皮
- 牡荆实
- 蔓荆实
- 辛夷
- 桑上寄生
- 杜仲
- 枫香脂
- 女贞实
- 木兰
- 蕤核
- 丁香
- 沉香
- 熏陆香
- 鸡舌香
- 藿香
- 詹糖香
- 檀香
- 乳香
- 降真香
- 苏合香
- 金樱子
- 卷十二（短集之）
- 桑根白皮
- 竹叶
- 吴茱萸
- 槟榔
- 栀子
- 紫矿骐竭
- 龙脑香及膏香
- 食茱萸
- 芜荑
- 枳壳
- 枳实
- 浓朴
- 茗、苦？
- 秦皮
- 秦椒
- 山茱萸
- 紫薇（音威）
- 胡桐泪
- 墨
- 棘刺花
- 猪苓
- 白棘
- 乌药
- 没药
- 龙眼
- 安息香
- 仙人杖
- 松罗
- 毗梨勒
- 庵（音谙）摩勒
- 郁金香
- 卫矛
- 海桐皮
- 大腹
- 紫藤
- 合欢
- 虎杖根
- 五倍子
- 伏牛花
- 天竺黄
- 密蒙花
- 卷十三（短集之）
- 巴豆
- 蜀椒
- 皂荚
- 诃梨勒
- 柳华
- 楝实
- 椿木叶
- 郁李仁
- 莽草
- 无食子
- 黄药根
- 雷丸
- 槲（音斛）若
- 白杨树皮
- 桄（音光）榔（音郎）子
- 苏方木
- 榉树皮
- 桐叶
- 胡椒
- 钓樟（音草）根皮
- 千金藤
- 南烛枝叶
- 无患子皮
- 梓白皮
- 橡实
- 石南
- 木天蓼
- 黄环
- 益智子
- 溲（音搜）疏
- 鼠李
- 椰子皮
- 枳（音止）（音矩）
- 小天蓼
- 小柏
- 荚（音迷）
- 紫荆木
- 紫真檀
- 乌臼木根皮
- 南藤
- 盐麸子
- 杉材
- 接骨木
- 枫（音风）柳皮
- 赤爪（侧绞切）木
- 桦木皮
- 藤子
- 榧（音匪）实
- 栾荆
- 扶木皮
- 木鳖子
- 药实根
- 钓藤
- 栾华
- 卷十四（短集之一）
- 棕榈子
- 木槿
- 芫花
- 榈木皮
- 楸木皮
- 卷十四（短集之二）
- 诸木有毒
- ？皮
- 露蜂房
- 鳖甲
- 蟹
- 蚱（音笮又音侧）蝉
- 蝉花
- 蛴螬
- 乌贼鱼骨
- 原蚕蛾
- 蚕退
- 缘桑螺
- 白僵蚕
- 鳗（音鳗）鲡（音黎）鱼
- ?（音驼）鱼甲
- 樗（丑如切）鸡
- 蛞（音阔）蝓（音俞）
- 蜗牛
- 石龙子
- 木虻（音萌）
- 蜚虻
- 蜚蠊（音廉）
- ?（音拓）虫
- 鲛鱼皮
- 白鱼
- 鳜（居卫切）鱼
- 青鱼
- 河豚（音屯）
- 石首鱼
- 嘉鱼
- 紫贝
- 卷二十一（短集之）
- 诸虫有毒
- 虾（音遐）蟆（音麻）
- 牡鼠
- 马刀
- 蛤蜊（音梨）
- 蚬（音显）
- 蚌
- 卷二十二（短集之一）
- 淡菜
- 虾
- 蚺（音髯）蛇胆
- 蛇蜕（音税）
- 蜘蛛
- 蝮蛇胆
- 白颈蚯蚓
- ?（音噎）?（乌红切）
- 葛上亭长
- 蜈蚣
- 蛤蚧
- 水蛭（音质）
- 斑蝥
- 田中螺汁
- 贝子
- 石蚕
- 雀瓮
- 白花蛇
- 乌蛇
- 金蛇
- 蜣螂
- 五灵脂
- 蝎
- 蝼（音娄）蛄（音姑）
- 马陆
- 蛙
- 鲮鲤甲
- 芫青
- 地胆
- 珂
- 蜻（音青）蛉（音零）
- 鼠妇
- 萤火
- 甲香
- 衣鱼
- 卷二十二（短集之二）