中医作为中华民族的文化瑰宝传承了几千年，进入现代，随着我国改革开放的深入开展，人民生活水平的不断提高，现代医疗技术手段不断的被引进与开展，规范化的现代医疗模式更多地被人们所接受。中医因为理论体系与主流意识形态的原因，规范化的程度一直不高，还不能为国际性的生命科学体系所完全接受，中医的科学研究在没有统一标准的情况下还不能发挥最大作用。因此，中医药的标准化就成为目前我国中医药事业发展亟待解决的基本问题和突破口。中医肛肠学同样迫切需要在继承传统经验、吸收现代研究成果、应用现代科研方法的基础上，研究和制定具有中医药特色、科学性强、严谨规范、能够为行业内实际应用、能被行业内外广泛接受和认可的诊断及治疗标准，来有效地解决目前因无章可循造成的行业松散状态。
2006年《中医肛肠科常见病治疗指南》（以下简称《肛肠科指南》）项目启动，该项目由国家中医药管理局政策法规与监督司立项，中华中医药学会负责，中华中医药学会肛肠分会承担，对中医特色优势明显病种的诊疗过程进行了规范化的梳理，并聘请中国标准化研究院专家指导标准化文件的起草。经过肛肠分会专家的论证、起草、修订、审校，国家中医药管理局标准化办公室组织专家把关、十几轮的反复修改，最终审查通过后，由中国中医药出版社出版。中医肛肠科有20个优势病种入选《肛肠科指南》，5项技术入选《中医医疗技术操作方案和技术手册》。全国81家重点专科协作组单位、9所大专院校、41家技术协作组单位参与了以上文件的编写、验证、修订等工作。
此次编写的中医标准化文件具有较高的可操作性。在其编写过程中，肛肠学科的各位专家都投入了极大的热情，同时中华中医药学会作为项目的组织者也付出了极大的努力，体现了科学严谨的态度。如肛肠学科的溃疡性结肠炎与消化科出现了交叉，最终在学会的协调下统一由消化科发布该病的指南。而同样与儿科交叉的儿童功能性便秘及与皮肤科交叉的肛门湿疹，则根据疾病的特点及患者就医的习惯以及在疾病治疗中的特色等因素，分别做出了儿童功能性便秘由《肛肠科指南》发布、肛门湿疹作为单独疾病由《肛肠科指南》发布、湿疹由《皮肤科指南》发布的决定，科学而客观地解决了多学科交叉的问题。
此次《肛肠科指南》的编写凝结了全国中医肛肠科中医人的心血，是该专科建设几十年经验与成果的一次集中总结。其推广应用必将规范中医肛肠领域诊疗行为，同时推动中医肛肠事业健康有序发展，为中医肛肠专业的国际交流奠定基础，为实现中医肛肠专业现代化作出重要贡献，使其焕发勃勃生机，从而走出一条更为宽广的发展之路。
