傅青主在赢得了官司，回到山西后，开始埋头于学术研究。
从这个时候开始，傅青主对所谓的举子业开始失去了兴趣，因为他在北京看到了官场的腐败，他觉得在那样乌七八糟的环境中是不会令自己快乐的，从此，他开始将注意力集中到了诸如史学、宗教等方面的研究中。
我们现在能够见到的傅青主最早的一幅书法作品，就是出自这个时期，是书写于1641年的《上兰五龙祠场圃记》，现在我就正在端详着这幅书法作品的拓本，我把自己的感受向大家汇报一下吧：它以行草风格书写，给人的感受是笔势圆转流畅，雍容华贵，从容不迫，看上去与明朝和平时期的文徵明、祝枝山等人的作品很有些相似之处，其笔意之娴雅，与王羲之的书法作品亦有相通之点。可见，前期正规的书法训练，给傅青主的书法奠定了坚实的基础，但是，由于此刻他还没有经历人生中真正的惊涛骇浪，因此，书法还没有达到真正的至高境界，至少，还没有让人望之骇然，精神为之一震的地步。
另外，傅青主到底是什么时候开始学医的呢？这是一个不解之谜，有的文献说他是家传医学：“家传故有禁方，乃资以自活”，这个说法不够确切，或者可能是家里有一些医书，但是他却没有学习，因为在他十几岁的时候父亲患了外感病，甚至到了病危的地步，根据文献，具体的症状是：“呃逆，直视，循衣摸床，发黄发瘢”，如果傅青主此时要是经过医学训练的话，那么用《伤寒论》中的方法就可以解决问题，至少是缓解，但他却相信神仙，听说南关文昌庙特灵，就跑去那里一心求神，结果拿回了一些莫名其妙的神仙药，父亲服下后病情有所减轻，他还认为是神仙显灵了，可见当时他还没有学医。
在他的妻子去世后，我们也没有找到他学习医学的记载，有可能他开始对此事关注，但还没有开始学。
实际上，傅青主自己的身体就非常的不好，小的时候曾经几次得了重病，差点死去，把他的父母吓坏了。
在傅青主三十五岁的时候，也就是他从北京打官司回来四年后，他的家庭再次遭遇打击，他哥哥傅庚的儿子傅襄病了，具体患的是什么病文献中没有记载，只知道没有多久就死去了，年龄只有二十岁，就在傅襄去世的当天，他年仅十九岁的妻子喝下毒药殉情自尽。
一对儿文静可爱的年轻夫妻就这样地相伴着离开了人世，这是何等的令人痛心啊，傅青主的心中感到了锥心刺骨般的疼痛，他自己描述到：“庚辰夏，舍侄物故，余长日拥被坐，昏昏然不出门，亦不见客，中楚不时作”。
由于关于傅青主的文献存世的比较少，而且研究的不够，所以其实我们对傅青主并不真正的了解，很多人只知道他是个水平非常高的医生，甚至很多人认为他是“神医”，但是，人们却不知道他的医术是怎么来的，更不知道他和他的家庭曾经被病魔逼迫到了何种地步！
现在，让我们来看看做为一个凡人的傅青主真正的情况吧，看看他是如何一步一步走上钻研医学的道路的。
傅青主的侄子去世的第二年春天（1641年），很不幸，傅青主自己也感染上了瘟疫，这次的病严重得用他自己的话来说是“几死”，就是几乎死掉。具体患病的情况傅青主自己没有记载，可见，这个时候他对医药并不了解，也没有解救的对策，多亏他的哥哥傅庚照顾他，为他精心调护，傅青主才活了下来，但是这次患病的时间却很长，直到秋天的时候还没有完全恢复。
可是，傅青主自己的病刚刚好，他的哥哥却不幸地染上了病，在第二年夏天，就去世了。
到底哥哥患病的情况如何，文献中也没有记载，我们已经无法了解当时的具体情况了，只知道这次失去兄长给傅青主的打击无比巨大。
傅青主自己记载说在那些日子里，他和老母亲两个人整天抱头痛哭（此时他父亲已经去世），母亲一会儿安慰他，他一会儿安慰母亲，但那都是无济于事的，随即两个人又痛哭。（日夜共老母哭泣，老母慰山，山慰老母，随复涕出，不能仰视。）
在那些日子里，傅青主甚至到了不能出门的地步，“直怕见人家有兄弟偕行者”，看到了人家兄弟，就想起了自己的哥哥，就会抑制不住自己，失声痛哭！
看到了吧，这就是傅青主年轻时期的真实状态，病魔一个一个地夺去了他的家人的生命，傅青主虽然此时已经学富五车，却无能为力，并因此被折磨得痛苦不堪。
怎么办啊傅青主？努力学习医学吧！千万不要让这样的事情再次发生了，快快找到你自己的位置吧，因为你日后将是我们的大医傅青主！
相信这是此时所有看官的心声。
我现在要告诉您，不要着急，因为老天爷对他的打击还没有真正的到来，在他的人生历程中，他还要经历更大风雨，遭受更大的打击！
就在傅青主的家庭连遭不幸的同时，大明王朝也即将走到了他的尽头，傅青主在这一年和几个同学去拜访了一位一百多岁的老和尚，这位老和尚曾经在辽东逗留过，傅青主他们非常想知道明军与清兵的交战情况，就问这位和尚：“熊廷弼大人在辽东怎么样啊？”
只见这位老和尚仰天长叹：“好个熊经略，好个熊经略！”然后伏地叩拜，半天不起，当他再次起身时，只见他已经是泪流满面了。
傅青主等人都被这位老和尚的举动所震撼了，忙问缘故，原来，熊廷弼被朝廷奸人陷害，已经被崇祯皇帝处以死刑了。
那天，大家的心中都感到了无比的沉重，每个人都似乎预感到了大明王朝的衰败。
同年，傅青主参加了乡试，没有中，那位老和尚前来道喜，傅青主感到很郁闷，心想这位拿我开心呢吧？就说：“老和尚你搞错了，我没中！”
老和尚很认真地说：“对，就是因为你没中，所以我才道贺！”
傅青主听了，恍然大悟，从此放弃了科举的念头。
在这些年里，傅山写出了《两汉书人姓名韵》这样一本专业书籍，此书考据严谨，工程浩大，是不下一定的功夫难以完成的着作，随后，他又写了《性史》一书，注意，这本《性史》不是写男女关系的，而是写心性的问题，探讨“孝友之理”，“取二十一史应在孝友传而不入者，与在孝友传而不足为经者，兼及近代所闻见者”，是一本纯粹的学术研究着作。
这个时候，唯一让人感觉有些兴奋的事情就是，三立书院发来了邀请，请傅青主去做老师，给学生们讲课。
这似乎是好事，要知道现在毕业能够留校任教也是好差事，可是，傅青主却怎么也乐不出来，因为，李自成已经马上要打过来了（或者说是已经打过去了）。
学校让傅青主等老师讲课的内容居然是军事教育等，有什么火攻、守城之类的。
也不知道文人傅青主老师的讲课效果如何，总之文献中只留下了他评价当时教育政策的一句话：“迂哉，蔡公（当时的巡抚，兼管三立书院的工作）之言，非可以起而行者也。”
其实这句话说的很空，也没有提出自己的见解，反正评价别人迂也好，自己迂也好，此刻都不管什么用了，因为天下的趋势已经无人能够阻拦了！
相信任何处在明清交替时期的人都会感到无比的困惑的，因为时局变化的太快了，公元1644年，也就是着名的甲申年，三月的时候李自成攻克了北京，崇祯皇帝上吊自尽了，明朝灭亡，正当这些忠于明朝的文人痛骂李自成的时候，五月份清兵就进驻了北京，然后清兵就横扫中原，估计当时的老百姓只能看见军队打来打去，估计都快分不清到底是谁打谁了。
清兵杀过来后，斗争的矛盾性质就变了，原来还是中原的内讧呢，这可就是外族入侵了，虽然现在满族已经和我们是一个大家庭了，我还有若干个哥们儿的老婆是满族人，但是那时候的认识可不是这样，否则您就没法儿理解为什么那么多人宁可掉脑袋也要抗争到底，那个时候人们对清兵的愤恨，和后来对日本兵的愤恨是一种性质的，抵抗外侮的。
就在眨眼之间，文人心中的支柱，大明王朝覆灭了，取而代之来统治自己的居然是些骑着马的外族人。
这对傅青主的来说才是无比巨大的真正的打击，甚至他整个一生都没能从这种阴影里走出来。在那些日子里，傅青主在数次努力参与抗争斗争后，感觉凭自己的力量是无法与整个局势抗衡的，怎么办？清兵此时开始要求所有的汉人剃头了，难道自己也要被剃成一个瓜皮头？那可真是奇耻大辱啊，怎么办呢？
此时，另一位医生喻嘉言的办法是：出家当和尚。
傅青主和喻嘉言的办法有着异曲同工之妙：出家当道士。
就在这一年，傅青主三十九岁，他上五峰山，拜还阳真人郭静中为师，出家做了道士。
现在，我来给各位解开傅青主到底是何时开始学医的谜团吧！
我翻遍了傅青主留下的文献，在甲申年做道士之前，没有他任何关于给人看病的记载，反而倒是他和他的家庭被病魔折磨得痛不欲生。
从他做了道士以后，文献中开始出现了给人诊病的记载，比如，他从五峰山下来后，开始到晋中各地游历，寻找反清复明的机会，到了哪个地方，老百姓就请他看病，有的时候想走都走不了，而且治疗效果还非常好，也不收老百姓的钱。（所至老幼男妇以疾请者，辄遮留不得去，从容诊治，多奇验，酬之金，不受也。）
另外一首他写于四十四岁的诗反应了他给一个叫花史的人的母亲看病，病痊愈了以后，花史用驴驮着傅青主来回往返的过程，诗下自注中写到：“花史母君得危疾，余设医愈之，每往来皆以其所爱黑驴驮之”。
各位自己看看吧，这前后有多大的反差吧，从之前被病魔逼迫得痛哭流涕，到后面的从容不迫，显然在五峰山上傅青主经历了一个人生的转折点，那么，到底在五峰山上发生了什么呢？
所有的疑点，集中到了这位还阳真人郭静中身上，他到底是谁呢？难道是他，使得傅青主发生了什么改变吗？
让我们来从文献里找找傅青主和郭静中的交往记载吧。
现在我们能够找到的，只有傅青主写的几首有关和郭静中道长交往的诗了，其中有一首题为《甲申八月访道师五峰龙池不遇，时道师在马首伪署，次又玄韵》，这里的伪署指的是李自成起义军的一个办公地点，可见当时郭静中道长和李自成军队有联系，这个时候李自成已经从北京撤出，成为了抵抗清军的一股力量，估计当时已经全乱了，管他什么李自成还是明朝残部，只要是抗击清军的都是团结的对象。这次傅青主并没有见到郭静中，失望而归。
然后，有一首诗是在冬天写的，题为《雪中过五峰道师留夜谈》，在那天，天空下着雪，冷风刮过山峰，发出尖锐的声音，傅青主奋力上山，来到了郭静中道师的道观，两人秘谈了一个晚上，他们的房间的灯一直亮了个通宵。
至于那天晚上他们到底谈论了什么？则成为了一个没有人知道的永久的秘密。
但是，我们从傅青主日后的行为中，似乎可以猜测出当晚谈话内容的一些大概。
从那以后，傅青主以道士的身份开始游走于各地，从事反清复明运动，显然这应该是当晚谈论的内容之一。
从那以后，傅青主开始留心医药，钻研医籍，最后终于成为了一代名医，相信这也是那晚谈论的议题之一。
傅青主的好友兼三立书院的同学戴廷栻在给傅青主写的传记中说：“道人（指傅青主）善病，受道还阳真人”，意思是说傅青主身体不好，经常患病，因此受道于还阳真人，这里，“善病”和“受道”有什么关系，为什么他要连在一起写，难道是还阳真人会对傅青主的身体有什么指教和帮助吗？
再联系傅青主写的《雪中过五峰道师留夜谈》这首诗中，曾把还阳真人郭静中比喻成给人间送药的仙人王子乔，我们则可以更加坚定前面的观点，在那个夜晚，健康问题一定是一个谈论的重要议题。
那么，这位还阳真人郭静中到底是个什么人呢？他神秘的面纱下面到底隐藏着什么秘密呢？
此事历来文献中记载甚少，这位还阳真人似乎神龙见首不见尾，外人很难遇到他，连傅青主在开始的时候找他都难，在傅青主拜他为师的时候，他已经是八十五岁的老人了，居然还能下山跑到李自成的军营中，实在是体力好的很啊。
现在，让我们解开这位郭大侠的神秘面纱吧！
原来，这位郭大侠本是明处士，看到明朝开始衰落了，就出家做了道士（师明处士，见明之衰，遁于黄冠），至于他是哪派的道士，从他赐予傅青主道号“真山”的“真”字来看，他是属于全真教龙门派的，因为龙门派以“道、德、通、元、静、真、常、守、太、清”等十字为号。
但是，他却似乎不拘于派别之限，而更擅长道教神霄派的修炼，神霄派最擅长什么功夫呢？一个是修内丹，一个是驱雷行雨。文献记载这位郭大侠“尝过华阴，遇异人刘，授以金丹之术及五雷法。由是往来晋楚燕赵间，善祈雨，遇旱则各省院司及州县之长吏，辄走书数百千里迎还阳为祷。祷时亦无他异，但结一坛，登坛以掌中雷印拍手一拍，则霹雳随起，大雨如注。或求之者众，则第书一符以付之，持者方入境，而雨已集矣。”
不知道这种道教文献里的记载有多大的程度可靠，估计是神话的成份居多，居然敢挑战天气预报，胆子似乎大了点儿，但是他们注重气功调理身体倒是真的。
更重要的是，这位郭大侠博览群书，“尤精于《易》”，显然，这对傅青主是有影响的，因为以傅青主这种钻研学问之人，《易经》那是必须研究的，而且后来傅青主还是此中高手。
总之，可以肯定的是，傅青主没有去学习驱雷行雨的方法，否则历史就将重写，后世会出现一个在气象局工作的傅青主，而不是像现在这样在卫生系统。
那么，傅青主在郭大侠这里到底学习了什么呢？神霄派的修炼内容里有什么对傅青主有启发呢？
这要从神霄派的理论核心说起，神霄派的理论基础是天人感应与内外合一说，谓天与我同体，人之精神与天时、阴阳五行一脉相通，此感必彼应。在他们的经典《雷说》中有这样的内容：“学者无求之他，但求之吾身可也。夫五行根于二气，二气分而为五行，人能聚五行之气，运五行之气为五雷。”
可见，他们在修炼气功的时候是以五行和阴阳为基础的，尤其注重五脏配五行之间的相生相克的关系。
那么，让我们来翻翻傅青主的医书吧，我们会吃惊地发现，傅青主所有的医方和治疗方法都用五行生克来分析，这是他的医书的最显着的特点。
原来如此啊！
而且，傅青主医学思想的一个主要特点是善于补益，却不擅长外感病的治疗，这也与道家修炼擅长补益有相似之处。
同样我也突然想到了，为什么后来陈士铎的《脉诀阐微》一书会托名是黄帝身边的雷神鬼臾区写的，原来是和雷神有感情啊。
而从傅青主留下的关于郭静中道长的记录中，我们确实可以发现，这是一位得道的高人。
在郭静中九十岁的时候（顺治五年），傅青主还写了一首诗《书扇贻还阳道师》，师的序中还记载了还阳真人用气功调治自己身体的事情。
我们猜测，也可能傅青主早就看过了些医书，但是没有得悟，但是在郭静中道长的启发下，开始把握住了五行辨证的精髓；或者是干脆，他就是在这里开始起步攻读医书的。
在后来，他刻苦攻读了《黄帝内经》等医书，同时用道家的思想来对其进行辅助消化，终于发展出了中医理论的一个独特的领域。
这就是事情的真相，关于傅青主的医术到底是从哪里来的，前人没有阐发过，这一直是一个谜团，大家都含糊带过，现在，我把它给剥离出来，希望大家能够理解，我们的傅青主并不是一个横空出世的神仙，而是一个饱经沧桑、备受疾病折磨，最终在祖国的古典文化的启发下，终于悟出健康之道的普通人。