民间流传着很多关于药王孙思邈的传说故事，有一则“龙宫方”的故事是这样讲的：有一天孙思邈外出，看到一个牧童正在杀一条小蛇，小蛇已经出血受伤。孙思邈十分心痛，就脱下自己的衣裳，和牧童交换小蛇，以此救下了小蛇。孙思邈用药物把小蛇封裹好，然后放生了。大概一个月之后，一个白衣少年遇见孙思邈，下马就拜谢，将孙思邈带到龙宫。少年请孙思邈见龙王，龙王设宴款待，将龙宫药方30首给了孙思邈。孙思邈出来龙宫，感到事情很奇异，就一一试验了龙宫药方，发现都有功效。后来写《千金方》时，就把龙宫方放在里面。又有人说龙宫方就是孙思邈写的《海上方》。
民间传说就是传说，基本没有正史依据。《旧唐书》和《新唐书》都有孙思邈传，但都没有这个故事的一丝线索。“龙宫方”的故事可能最早源于《千金翼方》中的一条说明。千金两方中提到龙的地方只有一处，就是《千金翼方·辟谷·服水》里说：“武德中，龙赍此一卷《服水经》授余，乃披玩不舍昼夜，其书多有蠹坏，文字颇致残缺，因暇隙寻其义理，集成一篇，好道君子勤而修之，神仙可致焉。”大致说，“龙”赠给我《服水经》，看得多了，有所损坏，文字都不全了，但究其义理，做了千金翼方中的《服水》篇。这里的“龙”到底是人名，还是机构名，还是神话中的龙，没有详细说，其他地方也没有什么证据。又加上“服水”与“龙王治水”的自然联想，及辟谷被赋予的神秘色彩，《千金翼方》中的“龙”就十分容易被附会为神话中的龙。
唐人段成式的《酉阳杂俎》就记载了这样的一个故事：因为天气大旱，需要祈雨，所以昆明池中的龙很忧虑，就去请僧人搭救，僧人说，这事你要找孙思邈先生。昆明池龙就去向孙思邈求救。孙思邈说，我知道昆明龙宫里有药方三十首，你传给我，我就救你。昆明池龙说，这些药方是天帝的，不让随便传啊。不过现在情况紧急，我就传给你吧。孙思邈得到药方后说，你回去吧，不会有事的。后来果然天降大雨，昆明池龙得以保命。孙思邈后来写千金方时，每卷都掺入了一个龙宫得来的药方。《酉阳杂俎》里的这个故事，明显是《千金翼方》里那句话演衍而成，这个故事当时很可能在民间已经十分流行了。
到了晚唐五代时的《续仙传》里，故事又发生了一些改变，和本文开头讲的那个故事已经十分接近了。《续仙传》里的“龙宫方”故事增加了一个“前传”，即孙思邈救小蛇的经过，去掉了天旱求雨的事情，使得故事有了一个温馨自然的“开头”；并且添加了白衣少年相迎，请进龙宫等细节，使得故事更加曲折吸引人。更为重要的是，改变了《酉阳杂俎》里孙思邈趁龙王之危强索药方的描写，改编成了龙王感恩赠给孙思邈药方。同时，大量增加的孙思邈的言行，充实了孙思邈的形象。“龙宫方”的故事大致完整了。
宋时的《太平广记》和《云笈七签》都转引了这个故事，大体保持了《续仙传》里的面貌。元代《历世真仙体道通鉴》一字不易地转录了这个故事。明代《列仙全传》也承袭了《续仙传》的说法。直到清代，《尚友录》中的“龙宫方”故事依然保持此种样态。上个世纪八十年代搜集整理的《中国民间故事集成》中，许多省市卷里仍可以看到这个故事。在“龙宫方”的故事流传过程中，发生一些变化是自然的，但故事主体基本保持下来，流传了一千多年。
“龙宫方”故事是孙思邈众多传说故事中最为重要的一个，贴近生活，喜闻乐见。更为重要的是，这个故事以民间话语生动阐释了《千金方·大医精诚篇》里包含的业务与道德并重、加强修养、淡泊名利、一视同仁、视患如己、尊重生命的医道精神。
