东垣谓百病之源，皆由喜怒、饮食、劳役所伤脾胃而然。其元气、谷气、营气；清气、卫气、生发诸阳之气，此六者皆胃气之别称也。脾胃既伤，则中气不足；中气不足，则不能滋养元气；不能滋养元气，则脏腑之真气皆不足，惟阴火独旺，上乘阳分无形质，元气受病矣！系在上焦心肺之气绝于外，心主荣，肺主卫，故荣卫失守，诸病生焉！此论发热尽由于内伤也，及河间所言则又不止此也。曰∶天真者，造化之元气也，在身亦得执天机而行六气，分地纪而运五行，巡历周身，化生万物。若调摄适宜，邪不能伤，或忧愁思虑、饥饱劳逸、大惊卒恐，真气耗乱，血气分离，其五行六气遂有愆阳伏阴兴衰之变，则百病作矣！于是着《原病式》以明其道，取《至真要大论》之病机以为提纲；用五运主病者以言五脏所属木火土金水之变；用六气为病者以言三阴三阳所属风寒湿热燥火气之变。在五行，则以金水易衰，火木易盛；在六气，则以湿热相火二气为病独多。至于五行过极，亢则害，承乃制，反兼鬼贼之化，此皆得为发热之病，岂止由于脾胃所始乎？
先生不以一家之学自至，益求其未至。乃谓天之阳，大于地之阴；地之阴，常不敌夫天之阳。人禀天之阳为气，地之阴为血，所以气常有余，血常不足，此年四十而阴气已衰半矣！故人不可恣欲以自戕，必保养天和，庶几阴无亏缺，可与阳齐，以终天年。夫天和者，天真元气也。负阴抱阳，元精立其体，元神致其用。苟不摇其精，则体全而用不竭；不劳其神，则用专而体不亏。然精之秘，非惟奉养天真而已，精秘则阴实。经曰∶阴成形。阴实则形全，阴虚则形敝，敝则出入废、升降息，孤阳之气安得不亢而飞越乎？先生尝曰∶人因喜怒、劳役、色欲之火，煎熬肾水、枯竭精血而病者十常六七。夫五脏皆属阴而藏精者也，肾又五脏阴气之主，故受五脏之精而藏之，故诸阴精血之病皆本于肾。其输纳之际必详察焉！大抵效仲景八味丸以五味各入五脏益其精，其中桂、附之辛开腠理、致津液、通气道，输而与之。补肾之法，固不越规矩，然地道之阴虚，则天道之阳不降，或阳乱于下而少阴之气不得收藏者，或精绝辟积而不输者，或两肾阴阳自有偏者，必皆揆度以治。然元气者，在身有根有苗，在太虚非阴非阳。其根也自天地开发，周流上下四方，随其所至以化行者，仲景所谓五脏元真是也。在肝则温化，其气升；在心则热化、其气浮；在脾则冲和之化，其气备；在肺则凉化，其气降；在肾则寒化，其气藏∶犹天以一元之气行于四时也。
此苗也，各从其本脏之元真而论治。元气所化者不足，则从其所化补之；元真所化者太过，则反其所化泻之。然则论元气独在脾胃者’此重水谷以资天真也。先生兼之受精以全角者，则又重两肾为元精，立寿命本始之地也。钱仲阳于肾有补无泻，正此意耳！二者皆从根本而治也。