一 注本草者．当先注明其所以主治之由．与所以当用之理．使读之者有义味可咀嚼也．兹集药性病情．互相阐发．庶便资用．若每处皆释．则重复烦琐．反生厌渎．故前后间见．或因药论辨．读者汇观而统会之可也．
一 上自神农本草经．以至李氏纲目．俱递有收载．自纲目以后．收载绝少．如燕窝之类．
一 自古本草以至近今本草．俱有是名．而今并无是药者．如预知子之类．俱为削去．
一 药品主治．诸家析言者少．统言者多．如治痰之药．有治湿痰者．有治燥痰者．诸书第以除痰概之．头痛之药．有治内伤头痛者．有治外感头痛者．诸书惟言治头痛而已．此皆相反之证．未可混施．举此二端．其余可以类推矣．又止言某病宜用．而不言某病忌用．均属缺略．兹集并加详注．庶无贻误．
一 每药先辨其气味、形色．次着其所入经络．乃为发明其功用．而以主治之证．具列于后．其所以主治之理．即在前功用之中．不能逐款细注．读者详之．
一 徐之才曰．药有宣、（上升下行、曰宣）、通、补、泻、涩、滑、燥、湿、（即润也）、轻、重十种．是药之大体．而本经不言．后人未述．凡用药者．审而详之．则靡所失遗矣．今为分阐．以标于本药之上．（此十剂也、陶隐居多寒热二剂、兹不具述、然本集燥剂、即陶氏之热剂、而通剂、乃徐氏之燥剂也．）
一 药品主治．已注明某脏某腑者．则不更言入某经络．以重复无用也．
一 阴、阳、升、降、浮、沉．已详于药性总义中．故每品之下，不加重注．
一 采用诸书．悉标其名氏．使知为先哲名言．有可考据也．间有删节数行数句者．以限于尺幅也．有增改数句数字者．务畅其文义也．其间广搜博采．义图贯通．取要删繁．词归雅饬一 凡假药不可不辨．如花草子、伪沙苑蒺藜．香栾、伪枳实枳壳之类．始则以伪乱真．渐一 同是药名．而力量浓薄悬殊．性味优劣迥别．如野白术与种白术、并江西白术之类．至一 本药而杂别种在内．用者即不能取效．如肆中柴胡．夹杂白头翁、小前胡、远志苗、丹参等于内．不细为拣去．不唯无益．而反有害矣．亦断不可不正之．
一 药品修治．必须如法．今肆中熟地黄用煮．菟丝饼加面之类．制治乖方．断不可用．俱为正之．
一 凡可以救荒者．收载稍繁．以其有裨于生成之实用也．
一 养生与治病．食物之宜否．关系非细．故收载不厌其繁．