- 秋燥门方
- 诸痢方治
- 三气门方
- 吐泻方治
- 饮伤脾胃方
- 附痹证诸方
- 附风门杂方
- 禽兽鱼虫禁忌并治第二十四（论辨二首、合九十法、方二十一首）
- 妇人杂病脉证并治第二十二(论一首、脉证合十四条、方十四首)
- 杂疗方第二十三（论一首、证一条、方二十二首）
- 惊痫方治一
- 惊痫方治二
- 妇人妊娠病脉证并治第二十（证三条、方九首）
- 妇人产后病脉证治第二十一（论一首、证六条、方八首）
- 身热方治
- 中风门方
- 疮痈肠痈浸淫病脉证并治第十八（论一首、脉证三条方、六首）
- 趺蹶手指臂肿转筋阴狐疝蛔虫病脉证治第十九（论一首、脉证一条、方五首）
- 惊悸吐衄下血胸满瘀血病脉证治第十六（脉证十二条、方五首）
- 呕吐哕下利病脉证治第十七（论一首、脉证二十七条、方二十三首）
- 变蒸方治
- 中寒门方
- 水气病脉证并治第十四（论七首、脉证五条、方九首）
- 黄胆病脉证并治第十五（论二首、脉证十四条、方七首）
- 痰饮咳嗽病脉证并治第十二（论一首、脉证二十一条、方十九首）
- 消渴小便利淋病脉证并治第十三（脉证九条、方六首）
- 腹满寒疝宿食病脉证治第十（论一首、脉证十六条、方十三首）
- 方成弗约之失
- 奔豚气病脉证治第八（论二首、方三首）
- 胸痹心痛短气病脉证治第九（论一首、证一首、方十首）
- 血痹虚劳病脉证并治第六（论一首、脉证九条、方九首）
- 肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七（论三首、脉证四条、方十五首）
- 古方名实辨
- 疟病脉证并治第四（证二条、方六首）
- 中风历节病脉证并治第五（论一首、脉证三条、方十二首）
- 湿病脉证第二（论一首、脉证十二条、方十一首）
- 百合狐惑阴阳毒病证治第三（论一首、证三条、方十二首）
- 金匮玉函要略方论序
- 乳痈方论第十五
- 产后乳汁或行或不行方论第十一
- 产后乳汁自出方论第十二
- 产后吹奶方论第十三
- 产后妒乳方论第十四
- 产后小便数方论第六
- 产后小便出血方论第八
- 产后阴脱玉门不闭方论第九
- 妇人阴蚀五疳方论第十
- 产后大小便不通方论第三
- 产后诸淋方论第五
- 产后痢疾作渴方论第一