- 湿三
- 水解三十
- 论炮炙三品药石类例
- 霍乱证三
- 三消之说当从火断二十七
- 论三品药畏恶相反
- 斥十膈五噎浪分支派疏二十三
- 痢疾三
- 汗下吐三法该尽治病诠十三
- 痰证三
- 消渴小便不利淋病脉证治第十三
- 中寒三
- 立诸时气解利禁忌式三
- 百合狐惑阴阳毒病证治第三
- 序三
- 落痂证治歌（凡五首，共三方）
- 痘后余毒证治歌（凡三十一首，共四十六方）
- 三因证治
- 滞下三因证治
- 三消脉证
- 三因吐血证治
- 女科三
- 心主三焦经虚实寒热证治
- 三焦精腑辨正
- 卷六/肺痈肺痿门（论一首 法十三条 律四条）
- 卷六/黄瘅门（法十五条 律三条）
- 三疰论
- 三阳合病脉证治
- 三消
- 三阴并合香港脚治法
- 三阳并合香港脚证治法
- 三气门方
- 卷四/热湿暑三气门（法二十五条 论三篇 律十一条）
- 喻嘉言脉论三则（痉损水）
- 杂疗方第二十三（论一首、证一条、方二十二首）
- 妇人妊娠病脉证并治第二十（证三条、方九首）
- 疮痈肠痈浸淫病脉证并治第十八（论一首、脉证三条方、六首）
- 呕吐哕下利病脉证治第十七（论一首、脉证二十七条、方二十三首）
- 三因论
- 三阴三阳藏象脉法
- 比类仲景《伤寒论》阳虚阴盛治法并死证三十二则
- 消渴小便利淋病脉证并治第十三（脉证九条、方六首）
- 腹满寒疝宿食病脉证治第十（论一首、脉证十六条、方十三首）
- 卷二/中寒门（论一首 法十三条 律三条 比类法六十九条）
- 奔豚气病脉证治第八（论二首、方三首）
- 格言三
- 申明仲景律书（附杂证时病药禁一条 附伤寒三阳经禁一条）
- 肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七（论三首、脉证四条、方十五首）
- 中风历节病脉证并治第五（论一首、脉证三条、方十二首）
- 三部分位