炮制过程中，制药场所的清洁卫生和安全防火，制药人员的劳动保护，制药工具的洁净、保养，以及药物的防霉、防腐、防冻等，与药物的质量，制药工人的健康，工具使用的期限，以至生命财产的安全，存在着密切的关系，必须予以充分注意。
（1）清洁卫生：制药场所的清洁卫生，对于药物的质量有一定的影响，例如蜂蜜、饴糖等味甜的药物，易为苍蝇、蚂蚁等昆虫所侵蚀，植物药的根、根茎、果实、种子等，易为老鼠及虫类所残害。如果不经常进行清洁工作。给老鼠、虫类以藏匿、聚集、孳生的机会，不仅使药物遭受损失，还可以因老鼠、虫类的叮爬而带来了秽物和病菌，危害人体，炮制的药物也可以被灰尘秽物所污染。因此，制药场所的清洁卫生，必须引起我们注意。制药场所一般要求空气流通，光线充足，四壁光洁，有条件的，地面最好用水泥、石灰之类建筑，便于经常冲洗。室内每日打扫，保持清洁；室外四周经常清除杂草，不堆积杂物，要有良好的下水道或阳沟，不使污水积留。洗药、浸药、漂药的地方，要经常冲洗。缸内污水要及时排除，夏季浸药必须经常换水。切制饮片的场所，最好和烘房、晒场接近，以便于将切制的饮片进行日晒或烘烤。晒药最好设置晒台，晒台位置高，受阳光照射的面广、时间长、空气流通、灰尘较少。如在地面晒药，应搭离地面3～4尺的架子，不使吸收地下潮湿，地面要经常打扫。制药人员要养成良好的个人卫生习惯，做到常洗澡、勤换衣、常剪指甲，工作时穿戴工作衣帽，必要时要戴口罩，不得随地吐痰，工作时不吸烟，以免烟灰掉落在药物里面。
（2）劳动保护：制药人员的劳动保护主要是防止药物中毒、工伤事故，搞好防暑降温，减少劳动量。炒制斑螯、乳香、没药等药物时，产生的气体，有剧烈的毒性或较强的刺激性，必须戴口罩以防止吸入毒性或刺激性物质，并须利用风扇使有毒物质迅速扩散。煅制砒石、皂矾等可产生有毒气体，最好在露天空旷地方进行，制药人员站在上风处，时间较长须轮换操作。炒制或煅制药物时，有条件最好戴上工作手套，以防烫伤。制藤黄、硫黄等有毒药物用的辅料，如豆腐等，要处理好，防止误食中毒。制巴豆霜去壳去油，最好戴橡皮手套，接触到巴豆油的手指，不要到处乱摸，应用肥皂水洗净。
（3）工具的洁净和保养：工具洁净保养关系到炮制质量，工作效率。工具管理不当，往往导致损坏而造成浪费，并影响工作。铁制工具如切药机、切药刀、炒药锅等，用后要洗净、擦干，如不用应涂一点油，以防生锈：竹木制工具如竹筛、簸箕、工作台等，要经常洗刷，清除积垢。
（4）防火、防霉、防腐、防冻：炮制过程中，一般离不开水与火，为了保障安全，保证药物质量，必须注意防火、防霉、防腐、防冻等事项。防火：工作完毕应即将火熄灭；药物炒炭或火煅后，应放地上摊冷，最好过夜入库；烘房要管理，严防药料烤焦燃烧，以至着火成灾。防霉：潮湿季节润药，要经常检查翻动，以免药物生霉。阴雨天切制饮片，必须烘干，以免生霉。防腐：漂制与浸制药物，必须经常换水，特别是夏季，每日需换水1～3次。防冻：冬季发芽，要防止冻坏芽苞，造成浪费。水制药物要放在避风温暖的地方，防止受冻后内部空松，外皮起皱，鲜药更要注意防冻，以免冻坏，变质失效。