脏腑内景，各有区处。咽喉二窍，同出一腕，异途施化。喉窍俗名气管，咽窍俗名食管。喉系坚空，连接肺本，为气息之路，呼吸出入，下通心肝之窍，以激诸脉之行，气之要道，以行肌表脏腑者也。咽系柔空，下接胃本，为饮食之路，水谷同下，并归胃中，乃粮运之关津，以司六腑之出纳者也。喉下为肺，谓之华盖，以覆诸脏，主呼吸出入，为人身之管龠。肺之下为心，为五脏六腑之君主。心有丝络，上系于肺。肺受清气，下乃灌注。心之下，有心包络，即膻中也，象为仰孟，为心之外胃。凡脾胃肝胆，两肾膀胱，各有一系，系于包络之旁，以通于心。此下有膈膜，遮蔽浊气，使不得上熏心肺。膈膜之下有肝，肝之短叶中，有胆附焉，此喉之一窍也。施气运化，熏蒸流行，以成脉络者如此。咽至胃，长一尺六寸，通谓之咽门。咽下是膈膜，膈膜之下为胃，主纳受饮食。胃之旁有脾，脾动则磨胃，食乃消化。胃之左有小肠，小肠上口，即胃下口，左回叠积十六曲。右有大肠，大肠上口，即小肠下口，亦盘十六曲，后趋肛门，以出滓秽。膀胱当小肠下口，受小肠泌别，其汁清者渗入于此，粗者转入大肠，脐下一寸，名水分穴，即指此而言也。膀胱上面，无所入之窍，止有下口，其出其入，全假三焦之气化施行，此咽之一窍也，资生气血，转化糟粕之出入者如此。
三焦之说，古今议论不一，但以字义求之则得矣。夫所谓“三”者，取象三才，其腔腹周遭上下，全体包罗不遗也。所谓“焦”者，火之象也，色赤属阳之谓也。其与心包络相表里者，以三焦为脏腑之外卫，心包络为君主之外卫，犹乎帝阙之重城，故皆属阳，均称相火，而其脉络，原自相通，故为表里也。肾有二，先天之本也，居于脊膂十四椎下，两旁相去各一寸五分，形如豇豆相并，左肾为天一之水，右肾为地二之火。诸家各立议论，前后迥不相同，然群言淆乱衷于圣，余惟以《内经》为主。张隐庵与其徒朱济公问答，于《内经》之旨，甚为晓畅，今录于后。
朱济公问曰∶有云两肾皆属水，命门居两肾之中，在脊之十四椎内，为三焦生气之原，有如坎中之满，此说甚为有理。
曰∶此不经之语耳。夫医道始于黄岐，脏腑血气之生始出入，非生知之圣，孰能究其精微，奈何后学不体认圣经，反好为异说。夫人之始终胚胎，犹太极耳。三月而成形，先生两肾，犹太极而生两仪，天一之水生木，木生火；地二之火生土，土生金；是先天止有水火，后天始备五行，五行之中有二火，合而为三阴三阳，以配六脏六腑。故《灵枢・本枢篇》曰∶“少阳属肾（此“肾”字指右肾，）肾上连肺（此“肾”字指左肾，）故将两脏。盖少阳乃三焦之生气，发于右肾，上合包络，为相火之原，左肾属水，上连于肺，故为两脏也。（右肾而上合左膻，左肾而上连右肺，是阴阳水火互换互根之道。）又《本脏篇》曰∶肾合于膀胱三焦，《素问・咳论》曰∶肾咳不已，则膀胱受之，久咳不已，则三焦受之。是《内经》止曰肾，而原无命门之名。盖以一肾合三焦，一肾合膀胱，是为两脏而配合两腑者也。夫人秉阴阳水火而生，若以两肾象坎，取其中满，而名命门，将何脏以象离，取其中虚，而又名何物乎。学人不可为前人所惑。
济公复问曰∶《难经》谓右肾主男子藏精，女子系胞。师言为相火生气之原，是左肾主水，右肾主火，精水止生于左，而胞当偏于右矣。曰∶非此之谓也。夫天地阴阳之道，在无形之气，曰阴曰阳，有形之气，曰水曰火，在人之元神，曰气曰精，天一生水，地二生火，阴中有阳，阳中有阴，两肾之气，交相贯通，左右皆有精有气，水即是精，火即是气，阴阳水火，互相资生，否则孤阳不生，独阴不长矣。夫藏精系胞之说，亦不过分别男女而言。然五脏主藏精，在女子未尝无精。胞为血海，膀胱为胞之室，在男子亦未尝无胞者也。胞之所系，盖言天主生物，地主成物，故系于右，乃气之所感，非胞之联系于右肾也。如云∶日月星辰系焉，亦大气之所载，日月营运，星移斗转，又何尝有所系带乎。