【本经】味苦寒。主热气，目痛，眦伤，泣出，明目，肠 ，腹痛，下利，妇人阴中肿痛。久服，令人不忘。一名王连。生川谷。
味苦，性寒，入手少阴心经。清心退热，泻火除烦。
《伤寒》黄连汤，黄连三两，桂枝三两，甘草三两，干姜三两，人参二两，大枣十二枚，半夏半升。治太阴伤寒，胸中有热，胃中有邪气，腹中痛，欲呕吐者。以中气虚寒，木邪克土，脾陷而贼于乙木，故腹中痛，胃逆而贼于甲木，故欲呕吐。君火不降，故胸中有热。姜、甘、参、枣，温中而补土，桂枝达乙木而止疼，半夏降戊土而止呕，黄连清君火而泻热也。
黄连阿胶汤，黄连四两，黄芩一两，芍药二两，阿胶三两，鸡子黄二枚。水五升，煎二升，去滓，入胶，消化，内鸡子黄，搅，温分三服。治少阴病，心烦不得卧。少阴水火同经，水胜则火负，火胜则水负。火本不胜水，其所以胜者，火旺而土燥也。君火下蛰，则心清而善寐，君火上亢，则心烦而不得卧。缘坎水根于离阴，燥土克水，消耗心液，神宇不清，是以生烦。黄连清君火而除烦，芩、芍清相火而泻热，阿胶、鸡子黄，补脾精而滋燥土也。
《金匮》黄连粉，黄连。研末，水调服。治浸淫疮。以土湿火升，郁生上热，湿热浸淫，结为毒疮。从口而走四肢则生，从四肢而入口则死。黄连泻湿热之浸淫也。
《伤寒》大黄黄连泻心汤，方在大黄。治太阳伤寒，误下成痞。附子泻心汤，方在附子。治心下痞硬，恶寒汗出。甘草泻心汤，方在甘草。治心下痞硬，干呕心烦。生姜泻心汤，方在生姜。治心下痞硬，干噫食臭。半夏泻心汤，方在半夏。治少阳伤寒，心下痞满。葛根黄连黄芩汤，方在葛根。治中风下后，喘而汗出。干姜芩连人参汤，方在干姜。治厥阴吐下后，食入即吐。小陷胸汤，方在栝蒌。治小结胸，脉浮滑者。白头翁汤，方在白头翁。治厥阴下利，热渴饮水者。乌梅丸，方在乌梅。治厥阴蛔厥，心中疼热。皆用之，以其泻心君之火也。
火蛰于土，土燥则火降而神清，土湿则火升而心烦。黄连苦寒，泻心火而除烦热，君火不降，湿热烦郁者宜之。土生于火，火旺则土燥，火衰则土湿，凡太阴之湿，皆君火之虚也。虚而不降，则升炎而上盛。其上愈盛，其下愈虚，当其上盛之时，即其下虚之会。故仲景黄连清上诸方，多与温中暖下之药并用，此一定之法也。凡泻火清心之药，必用黄连，切当中病即止，不可过剂，过则中下寒生，上热愈甚。庸工不解，以为久服黄连，反从火化，真可笑也。