去净毛，浆水浸焙用。生用入心，醋炙入肝胆，酒炙上行。黄芩、龙骨、理石为使，恶菊花、元参、鲜皮、芫花、僵蚕，畏冬花、牛膝，胜乌头，解巴豆毒。忌猪肉，恶冷水。
大苦，大寒，无毒。手少阴心经药也。清心退热，泻火除烦，镇肝凉血，解渴止汗。浓肠胃而止泻痢，开伏梁而泻痞满，解痈疽疮疥之毒，退目痛及 伤之火。虚寒者勿用。舌苔红者急用之。产后忌之。
生巫阳川谷及蜀郡太山之阳。二八月采。苏颂《图经》曰∶今江、湖、荆、夔州郡亦有，而以宣城九节坚重相击有声者为胜，施、黔者次之，东阳、歙州、处州者又次之。苗高尺许，叶似甘菊，四月开黄花，六月结实似芹子色黄。其苗经冬不凋。汉末本草，惟取蜀郡黄肥而坚者为胜，唐时以澧州者为胜，今则雅州、眉州者为良。药物之兴废不同若此。
小儿口疮，同干姜为末掺之。（验方第一。）
消渴尿多，蜜丸服。又同花粉丸服。又入猪肚白淫，脉数有热，同茯苓丸服。（第三。）
赤痢已久，为末，鸡子（第四．）
热毒血痢，水煎一两，露一宿，空腹服。（第五。）
热毒赤痢，同当归焙末，入元香少许，米汤下二钱。（第六。）
赤白痢久，并无寒热，同乌梅烧末，米汤下。（第七。）
赤白暴痢，如鹅鸭肝，痛甚，同黄芩各一两煎热服。（第八。）
一切诸痢，不问冷热赤白，谷滞休息。黄连两半，龙骨一两，真附子八钱，干姜一两，先以水两盅入铜器中，火沸取下着土上，沸止又入水两盅，如此九次；纳诸药入水内，再煎沸，辄取下，沸止又上火，如此九次，可得二三盅，顿服即止。（第九。）
下痢腹痛，赤白下重，酒煎两服。（第十。）
小儿久痢赤白有火，水煎，蜜合服五次。（十一。）
脏毒下血，净连半斤，入猪大肠内，砂釜煮烂，取连焙末，捣肠合丸，米汤下。（十二。）
赤白痢，日夜无度，同吴茱萸各二两，同炒香，各为末，以米饭合丸豆大，每服三十丸。
赤痢甘草汤下黄连丸，白痢生姜汤下吴茱萸丸，各十五丸。赤白痢并服，米汤下，甚效。（十三。）
肠风。同上。（十四。）
脾积食泻，捣蒜合丸豆大，白汤下五十丸。（十五。）
痢痔肠脱，为末，冷水合敷之。（十六。）
鸡冠痔疾，为末敷之。（十七。）
痔病秘结，同枳壳丸服。（十八。）
暴赤目痛，同干姜、杏仁为末，绵包浸汤，闭目乘热洗之。（十九。）
小儿赤目，水合敷足心。（二十。）
烂弦风眼，黄连十文，槐花、轻粉少许，为末，男儿乳合之，饭上蒸过，帛包之，熨目三四次．（二十一。）
目猝痒痛，乳汁浸点，诸目悉治。（二十二。）
泪出不止，水浸浓汁渍拭之。（二十三。）
口舌生疮，酒煎时含。（二十四。）
小儿鼻 ，鼻下两道赤色，有疳，以米泔洗之，黄连末敷之。（二十五。）
小儿月蚀生耳后，为末敷之。（二十六。）
小儿食土，取好黄土煎黄连渍之，晒干与食。（二十七。）
腹中儿哭，煎浓汁呷之。妇科胎哭是也。（二十八。）
子烦、口干不卧，为末，粥下一钱。（二十九。）
痈疽肿毒，已溃未溃皆可，同槟榔末、鸡子清合敷。（三十。）
中巴豆毒利不止，同干姜末水下。（三十一。）
心火实热，水煎服。（三十二。）
心猝热痛，水煎服。（三十三。）
阳毒狂奔，同石膏末，甘草水下。（三十四。）
骨节积热黄瘦，童尿浸，水煎服。（三十五。）
小儿疳热流注，通身疮蚀，或潮热，肚胀作渴，以黄连五两入猪肚中，铺糯米上蒸烂，捣千杵丸服。（三十六。）
呕烦心热，黄连五分，干姜三分。（三十七。）
中热邪毒，同巴豆吐之。（三十八。）
香连丸 黄连 木香蜜丸豆大，每白汤下三十。治赤白诸痢，里急腹痛。（诸方第一。）
赴筵散 黄连 干姜为末掺之。治口疮。（第二。）
黄连汤 黄连 桂枝 炙草 人参 半夏 姜 枣治腹痛欲呕，心热甚者。（第三。）
黄连阿胶汤 黄连 阿胶 黄芩 白芍 鸡子黄治心烦不眠。（第四。）
黄连粉 黄连为末。水合敷。治浸淫疮。（第五。）
下痢赤白，黄苔，便赤，脉数。黄连（五分） 白芍（一钱五分） 苦参（一钱） 当归（一钱五分） 枳壳（一钱五分） 甘草（一钱） （第六）